Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO28Q9NVF7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO28Q9NVF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms