Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG3Q9NT62 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG3Q9NT62 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms