Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMILIN3Q9NT22 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMILIN3Q9NT22 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms