Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms