Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP3Q9NS15 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms