Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP4Q9NRJ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP4Q9NRJ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms