Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLE3Q9NRF9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms