Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4Q9NQC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms