Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MEPEQ9NQ76 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms