Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STN1Q9H668 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms