Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SENP3Q9H4L4 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SENP3Q9H4L4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms