Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNMDQ9H2S6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms