Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCOLN1Q9GZU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCOLN1Q9GZU1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms