Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms