Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YTHDF1Q9BYJ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms