Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSDMCQ9BYG8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GSDMCQ9BYG8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms