Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHANK3Q9BYB0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHANK3Q9BYB0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms