Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOL6Q9BWW8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOL6Q9BWW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms