Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC94Q9BW85 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC94Q9BW85 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms