Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C16orf70Q9BSU1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C16orf70Q9BSU1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms