Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RTKNQ9BST9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms