Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDHD3Q9BSH5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms