Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MESP1Q9BRJ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms