Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLF1Q9BQI6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms