Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms