Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3R4Q99570 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms