Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD1Q99460 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD1Q99460 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms