Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN18Q96SJ8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms