Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRNP1Q96S65 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms