Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS6KC1Q96S38 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms