Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms