Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms