Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A9Q96Q91 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms