Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD6Q96NK8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD6Q96NK8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms