Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms