Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPGRIP1Q96KN7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms