Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG3Q96JB2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms