Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPD52L3Q96J77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms