Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM17Q96I25 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms