Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCANQ96GW7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCANQ96GW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms