Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RNF183Q96D59 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF183Q96D59 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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