Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCC1Q96CN9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms