Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD2Q96BF3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms