Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTI1AQ96AJ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1AQ96AJ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms