Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CELF1Q92879 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF1Q92879 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms