Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TAF4BQ92750 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF4BQ92750 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms