Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SSH3Q8TE77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms