Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms