Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDM1Q8NG50 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDM1Q8NG50 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms