Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF397Q8NF99 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF397Q8NF99 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms